Полная версия

Главная arrow Экология arrow О роли когерентности в сверхслабых взаимодействиях в биосистемах и биосфере

  • Увеличить шрифт
  • Уменьшить шрифт


<<   СОДЕРЖАНИЕ ПОСМОТРЕТЬ ОРИГИНАЛ   >>

В. Белки, содержащие BLUF-домены

В белках, содержащих BLUF-домены, кофактором является нековалентно связанный с протеином полностью окисленный FAD. Синглетное возбуждение индуцирует перенос электрона с остатка тирозина на флавиновое кольцо, что сопровождается возникновением радикальной пары, вследствие чего боковая цепь остатка глутамина, расположенного поблизости, поворачивается, далее электрон возвращается на тирозин. При этом реорганизуется система водородных связей [Kennis and Groot, 2007]. Происходит согласованная перестройка водородных связей, как и в вышеописанных случаях. Сигнальное состояние формируется с высоким квантовым выходом на субнаносекундном масштабе. Возвращение к основному состоянию происходит на секундном масштабе. Индуцируемые светом изменения в четвертичной структуре и динамике сопровождают перенос сигнала на эффекторную область, как и для LOV- протеинов.

Г. Фитохромы

Фитохромы и бактериофитохромы содержат билиновый хромофор, линейный тетрапиррол. Поглощение фотона вызывает переход состояния, в котором поглощается красный свет, в состояние, в котором поглощается дальний красный свет, и наоборот. Любое из этих состояний может быть основным. Этот переход начинается с быстрой (Z/E) изомеризации вокруг С15=С 16 двойной связи между кольцами С и D в билиновом хромофоре, соответствующей вращению кольца D [Kennis and Groot, 2007]. Последующие шаги происходят на миллисекундном — секундном масштабе [Dasgupta et al., 2009]. Изменения в конформации и динамике в окрестности хромофора передаются на эффекторный домен междоменными взаимодействиями или изменениями в междоменных связывающих спиралях.

 
<<   СОДЕРЖАНИЕ ПОСМОТРЕТЬ ОРИГИНАЛ   >>